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微生物rna系统生物学实验室

人体微生物学 rna生物学

       中国科学院上海巴斯德研究所是由中国科学院和法国巴斯德研究所(institut pasteur)共建的国际化研究机构,聚焦病原微生物基本生命活动规律、重大传染性疾病的致病机制等关键科学问题,开展基础与转化型研究,服务全球公共健康。上海巴斯德研究所具有完善的病原生物学、免疫学、疫苗学学科布局,拥有先进的科研装备与设施,是活跃在全球传染病防控领域的一支重要力量,是国际高端人才引进、一带一路科技合作与人才培养的重要基地和窗口。

        课题组长晁彦杰博士2014年从德国马普感染生物学研究所和柏林洪堡大学获得博士学位,2014-2016在德国维尔茨堡大学医学院、德国与欧盟科学院院士jörg vogel实验室进行博士后研究,2016-2020在美国霍华德-休斯医学研究所和塔夫茨大学医学院andrew camilli实验室进行博士后研究。2020年9月底,回国加入中国科学院上海巴斯德研究所、健康发育与微生物学国际研究中心(cmdh),任研究员、微生物rna系统生物学研究组长、博士生导师,获得国家海外高层次人才、中科院百人计划、上海市海外高层次人才等项目资助。

        晁彦杰博士长期从事病原微生物学和非编码rna方向的研究,目标为阐释微生物基因表达和调节的分子机制,了解人体共生微生物和病原性细菌定植和感染的过程和机理。利用先进的高通量测序技术和系统生物学分析方法,近年来陆续发现并详细鉴定了一类新型的非编码小rna(来自于细菌信使mrna的3'非翻译区),下一步将对此类小rna的产生机制和微生物中的rna代谢过程进行系统性地深入探索。另外,晁彦杰博士参与的rna工作在细菌中首次发现了ii型crispr-cas9免疫防御系统,基于该系统开发的cas9基因编辑工具革命性地推动了真核生物的基因组编辑。多次在nature, molecular cell, embo j, embo mol medicine, pnas等顶级杂志上发表高影响力论文,受到各个杂志点评和f1000prime专家推荐,累计引用超过5000次,单篇引用最高达到2000次。兼任bmc genomics杂志编委,mbio等20多家权威sci期刊审稿人。

 

       目前本实验室有多个博后和助理职位空缺,常年招收实习生与研究生,欢迎对微生物rna研究感兴趣的博士、硕士、联合培养研究生申请加入实验室!(申请方法与职位详情参见中科院巴斯德所,或通过电子邮件直接联系pi)

关键词:病原微生物,人体微生物,非编码rna,rna结合蛋白,rna测序,tn-seq,细胞膜稳态调节,crispr/cas

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上海巴斯德研究所:

 

近期新闻报道:

【文汇报】

【解放日报-上海观察】

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人体微生物的rna系统生物学研究

本课题组主要开展人体共生细菌和病原性细菌的定植、致病与耐药过程和机制研究,利用单细胞测序,rna组测序,clip-seq,tn-seq合成生物学等先进手段分析微生物基因表达调控,mrna转录加工,非编码rna调节机制,新型rna结合蛋白质的鉴定与功能等研究工作。